W połowie XVI w. dużą część budynku zniszczył pożar. Przy okazji odbudowy Ratusz rozbudowano, już w stylu renesansowym i zyskał zachowany do dziś kształt. Na ratuszowej wieży postawiono wtedy nowy hełm, a na iglicy posadowiono pozłocony posąg panującego wówczas w Polsce króla Zygmunta II Augusta. Wewnątrz hełmu zainstalowano zespół grających dzwonów zwany carillonem, a wieża została wyposażona w czterostronny zegar.
W 1945 roku Ratusz Głównego Miasta w Gdańsku zostały poważnie zniszczony - zawaliła się m.in. wieża. Obiekt stopniowo odbudowywano wyposażając w oryginalne elementy, których część się zachowała. W roku 1970, odbudowany Ratusz przekazano na siedzibę Muzeum Historii Miasta Gdańska, a do budynku powróciły zabytkowe meble i przedmioty. 30 lat później na ratuszowej wieży został zamontowany nowy carillon – czyli kurant dzwonowy.